Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NefhP19246 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NefhP19246 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NefhP19246 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NefhP19246 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NefhP19246 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NefhP19246 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NefhP19246 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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NefhP19246 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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NefhP19246 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NefhP19246 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NefhP19246 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NefhP19246 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NefhP19246 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NefhP19246 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NefhP19246 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NefhP19246 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NefhP19246 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NefhP19246 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NefhP19246 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NefhP19246 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NefhP19246 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NefhP19246 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NefhP19246 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NefhP19246 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NefhP19246 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NefhP19246 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NefhP19246 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NefhP19246 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
NefhP19246 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NefhP19246 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NefhP19246 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NefhP19246 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NefhP19246 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NefhP19246 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NefhP19246 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NefhP19246 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NefhP19246 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NefhP19246 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NefhP19246 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NefhP19246 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NefhP19246 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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NefhP19246 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NefhP19246 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NefhP19246 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NefhP19246 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NefhP19246 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NefhP19246 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NefhP19246 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NefhP19246 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NefhP19246 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NefhP19246 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NefhP19246 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NefhP19246 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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NefhP19246 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NefhP19246 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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NefhP19246 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NefhP19246 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NefhP19246 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NefhP19246 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NefhP19246 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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NefhP19246 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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NefhP19246 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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NefhP19246 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NefhP19246 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NefhP19246 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NefhP19246 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NefhP19246 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NefhP19246 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NefhP19246 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NefhP19246 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NefhP19246 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NefhP19246 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NefhP19246 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NefhP19246 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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