Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms