Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18528 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18528 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18528 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18528 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18528 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18528 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18528 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18528 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18528 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18528 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18528 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18528 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18528 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18528 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18528 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18528 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18528 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18528 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18528 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18528 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18528 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18528 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18528 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18528 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18528 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18528 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18528 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18528 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18528 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18528 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18528 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18528 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18528 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18528 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18528 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18528 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18528 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18528 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18528 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18528 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18528 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18528 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18528 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18528 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18528 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18528 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18528 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18528 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms