Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PcnaP17918 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcnaP17918 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
PcnaP17918 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PcnaP17918 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PcnaP17918 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
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PcnaP17918 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PcnaP17918 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PcnaP17918 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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