Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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