Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

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Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl1P12850 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms