Protein–RNA interactions for Protein: P12246

Apcs, Serum amyloid P-component, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcsP12246 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApcsP12246 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApcsP12246 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
ApcsP12246 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
ApcsP12246 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms