Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa1P11477 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa1P11477 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa1P11477 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa1P11477 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa1P11477 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa1P11477 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms