Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm37241-201ENSMUST00000191736 523 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm37963-201ENSMUST00000195351 613 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Rhox3f-201ENSMUST00000115172 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Rhox3g-201ENSMUST00000119965 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 1700001F09Rik-201ENSMUST00000178178 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Rhox3f-203ENSMUST00000184451 1008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm28648-201ENSMUST00000190092 343 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm37560-201ENSMUST00000194289 1000 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm38250-202ENSMUST00000195108 462 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm45715-201ENSMUST00000206991 434 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Olfr1077-ps1-201ENSMUST00000213225 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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