Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms