Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CopeO89079 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CopeO89079 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CopeO89079 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CopeO89079 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CopeO89079 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CopeO89079 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CopeO89079 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CopeO89079 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CopeO89079 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CopeO89079 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CopeO89079 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CopeO89079 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CopeO89079 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CopeO89079 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CopeO89079 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CopeO89079 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CopeO89079 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CopeO89079 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CopeO89079 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CopeO89079 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
CopeO89079 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CopeO89079 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CopeO89079 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CopeO89079 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CopeO89079 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CopeO89079 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CopeO89079 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CopeO89079 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CopeO89079 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CopeO89079 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CopeO89079 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CopeO89079 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CopeO89079 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CopeO89079 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CopeO89079 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CopeO89079 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CopeO89079 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CopeO89079 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CopeO89079 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CopeO89079 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CopeO89079 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CopeO89079 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CopeO89079 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CopeO89079 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CopeO89079 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CopeO89079 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CopeO89079 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CopeO89079 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CopeO89079 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CopeO89079 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CopeO89079 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CopeO89079 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CopeO89079 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CopeO89079 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CopeO89079 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CopeO89079 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CopeO89079 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CopeO89079 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CopeO89079 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CopeO89079 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CopeO89079 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CopeO89079 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CopeO89079 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CopeO89079 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CopeO89079 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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