Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms