Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms