Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms