Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptpn20O55082 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms