Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Copb2O55029 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Copb2O55029 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Copb2O55029 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Copb2O55029 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Copb2O55029 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Copb2O55029 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Copb2O55029 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Copb2O55029 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Copb2O55029 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Copb2O55029 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Copb2O55029 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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