Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NlkO54949 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NlkO54949 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NlkO54949 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NlkO54949 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NlkO54949 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NlkO54949 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NlkO54949 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NlkO54949 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NlkO54949 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NlkO54949 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NlkO54949 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NlkO54949 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NlkO54949 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NlkO54949 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NlkO54949 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NlkO54949 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NlkO54949 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NlkO54949 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NlkO54949 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NlkO54949 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NlkO54949 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NlkO54949 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NlkO54949 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NlkO54949 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NlkO54949 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NlkO54949 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NlkO54949 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NlkO54949 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NlkO54949 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NlkO54949 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NlkO54949 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NlkO54949 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NlkO54949 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NlkO54949 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NlkO54949 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NlkO54949 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NlkO54949 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NlkO54949 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NlkO54949 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NlkO54949 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NlkO54949 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NlkO54949 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NlkO54949 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NlkO54949 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NlkO54949 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NlkO54949 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NlkO54949 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NlkO54949 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NlkO54949 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms