Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

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Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsksO54887 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsksO54887 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TsksO54887 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsksO54887 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsksO54887 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsksO54887 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsksO54887 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsksO54887 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TsksO54887 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsksO54887 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsksO54887 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsksO54887 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsksO54887 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TsksO54887 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TsksO54887 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsksO54887 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsksO54887 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TsksO54887 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TsksO54887 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsksO54887 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsksO54887 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TsksO54887 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TsksO54887 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TsksO54887 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsksO54887 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsksO54887 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsksO54887 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsksO54887 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsksO54887 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsksO54887 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsksO54887 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsksO54887 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsksO54887 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsksO54887 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsksO54887 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsksO54887 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsksO54887 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsksO54887 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TsksO54887 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsksO54887 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsksO54887 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsksO54887 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TsksO54887 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TsksO54887 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TsksO54887 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TsksO54887 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TsksO54887 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TsksO54887 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TsksO54887 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TsksO54887 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TsksO54887 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TsksO54887 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TsksO54887 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TsksO54887 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms