Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdk5r2O35926 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms