Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Opn1mwO35599 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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