Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Kcns1O35173 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
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Kcns1O35173 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Kcns1O35173 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Kcns1O35173 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Kcns1O35173 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Kcns1O35173 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Kcns1O35173 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Kcns1O35173 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Kcns1O35173 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Kcns1O35173 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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