Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hps1O08983 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hps1O08983 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hps1O08983 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hps1O08983 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hps1O08983 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hps1O08983 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hps1O08983 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms