Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Eftud2O08810 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms