Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MttpO08601 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MttpO08601 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MttpO08601 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MttpO08601 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MttpO08601 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MttpO08601 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MttpO08601 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MttpO08601 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MttpO08601 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MttpO08601 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MttpO08601 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MttpO08601 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MttpO08601 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MttpO08601 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MttpO08601 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MttpO08601 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MttpO08601 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MttpO08601 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MttpO08601 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MttpO08601 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MttpO08601 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MttpO08601 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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MttpO08601 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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MttpO08601 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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MttpO08601 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
MttpO08601 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MttpO08601 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MttpO08601 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MttpO08601 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MttpO08601 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MttpO08601 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MttpO08601 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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MttpO08601 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MttpO08601 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MttpO08601 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MttpO08601 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MttpO08601 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MttpO08601 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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MttpO08601 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MttpO08601 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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MttpO08601 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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MttpO08601 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MttpO08601 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MttpO08601 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MttpO08601 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MttpO08601 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
MttpO08601 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MttpO08601 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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MttpO08601 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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MttpO08601 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MttpO08601 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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MttpO08601 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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MttpO08601 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
MttpO08601 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
MttpO08601 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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MttpO08601 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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MttpO08601 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MttpO08601 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MttpO08601 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MttpO08601 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MttpO08601 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MttpO08601 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
MttpO08601 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MttpO08601 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MttpO08601 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MttpO08601 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MttpO08601 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MttpO08601 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MttpO08601 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MttpO08601 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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