Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS9

E030018B13Rik, RIKEN cDNA E030018B13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E030018B13RikJ3QMS9 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
E030018B13RikJ3QMS9 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms