Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms