Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
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