Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI0

Gm20815, Predicted gene, 20815, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20815J3KMI0 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Gm20815J3KMI0 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20815J3KMI0 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm20815J3KMI0 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm20815J3KMI0 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm20815J3KMI0 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm20815J3KMI0 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20815J3KMI0 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20815J3KMI0 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20815J3KMI0 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20815J3KMI0 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20815J3KMI0 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20815J3KMI0 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20815J3KMI0 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20815J3KMI0 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20815J3KMI0 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20815J3KMI0 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20815J3KMI0 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20815J3KMI0 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20815J3KMI0 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms