Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Taf4bG5E8Z2 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Taf4bG5E8Z2 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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Taf4bG5E8Z2 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Taf4bG5E8Z2 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Taf4bG5E8Z2 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Taf4bG5E8Z2 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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