Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms