Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-M1F7CXU4 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms