Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Amotl1-206ENSMUST00000223132 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Prpf40a-201ENSMUST00000076313 7374 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Rbm12-202ENSMUST00000109604 6635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Itga2-201ENSMUST00000056117 7108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Ccpg1-202ENSMUST00000085350 2969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Anapc1-203ENSMUST00000110333 4214 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Deptor-202ENSMUST00000096433 8547 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Akt3-201ENSMUST00000019843 1511 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Ctso-201ENSMUST00000029649 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Bcas3-205ENSMUST00000108061 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm29685-201ENSMUST00000219670 2365 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Acmsd-201ENSMUST00000038006 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Sptan1-208ENSMUST00000129241 7585 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Slc2a2-201ENSMUST00000029240 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Dusp27-201ENSMUST00000085992 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Dync1i2-205ENSMUST00000112139 2483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 AC113125.1-201ENSMUST00000226852 1774 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Lrrc15-201ENSMUST00000064606 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Phka2-201ENSMUST00000033652 4133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Thsd1-202ENSMUST00000160585 3276 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Pde4b-201ENSMUST00000030251 1923 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Ces1f-201ENSMUST00000034178 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Ebpl-201ENSMUST00000022494 10092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Fubp1-220ENSMUST00000200524 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Pex2-203ENSMUST00000164828 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 9630028H03Rik-202ENSMUST00000153402 1559 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm16536-201ENSMUST00000162209 1589 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 E330035G20Rik-201ENSMUST00000221094 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Myrfl-201ENSMUST00000048229 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm45837-201ENSMUST00000084894 4139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gramd4-201ENSMUST00000088931 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Olfr63-203ENSMUST00000217023 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Olfr975-202ENSMUST00000216647 2848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Kdm5d-207ENSMUST00000189069 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Il1rl1-202ENSMUST00000097772 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Hdac7-206ENSMUST00000119670 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm44541-201ENSMUST00000207837 2907 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 4930447C04Rik-208ENSMUST00000136075 1970 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm13415-201ENSMUST00000131886 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Olfr517-202ENSMUST00000216500 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Pnpla1-202ENSMUST00000114737 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Pnpla1-201ENSMUST00000056866 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Prn-202ENSMUST00000136783 3370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm26790-201ENSMUST00000181078 2291 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 4932438H23Rik-202ENSMUST00000114076 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms