Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8005F6YKY3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms