Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm8247F6VRJ8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Gm8247F6VRJ8 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Gm8247F6VRJ8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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