Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms