Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm340F6RGI3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
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