Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
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Rdh16f1E9Q9P8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Rdh16f1E9Q9P8 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Rdh16f1E9Q9P8 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Rdh16f1E9Q9P8 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Rdh16f1E9Q9P8 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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