Protein–RNA interactions for Protein: E9Q166

Atad2b, ATPase family, AAA domain-containing 2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2bE9Q166 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
Atad2bE9Q166 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atad2bE9Q166 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atad2bE9Q166 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atad2bE9Q166 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atad2bE9Q166 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Atad2bE9Q166 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atad2bE9Q166 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atad2bE9Q166 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atad2bE9Q166 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atad2bE9Q166 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atad2bE9Q166 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atad2bE9Q166 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atad2bE9Q166 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atad2bE9Q166 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atad2bE9Q166 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atad2bE9Q166 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Atad2bE9Q166 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atad2bE9Q166 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Atad2bE9Q166 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atad2bE9Q166 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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