Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms