Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms