Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf217D3YYI7 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
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