Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Phf11bB4XVQ1 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Phf11bB4XVQ1 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Phf11bB4XVQ1 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Phf11bB4XVQ1 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Phf11bB4XVQ1 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Phf11bB4XVQ1 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Phf11bB4XVQ1 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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