Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Clrn2B2RVW2 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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