Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.89■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms