Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zbed5B2RPU8 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms