Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6880A3KG45 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms