Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtf1A2AQ19 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Rtf1A2AQ19 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Rtf1A2AQ19 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Rtf1A2AQ19 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Rtf1A2AQ19 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Rtf1A2AQ19 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Rtf1A2AQ19 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Rtf1A2AQ19 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Rtf1A2AQ19 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Rtf1A2AQ19 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
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Rtf1A2AQ19 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Rtf1A2AQ19 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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