Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttll9A2APC3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms