Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SetxA2AKX3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms