Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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